Talvez você já o conheça. Mas para aqueles que ainda não sabem, existe um excelente editor de vídeos para Linux: o Avidemux.
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Instale o Selene Media Encoder – um conversor de áudio / vídeo
Selene é um conversor de áudio / vídeo que trabalha com os formatos OGG/OGV/MKV/MP4/WEBM/OPUS/AAC/FLAC/MP3/WAV. Seu objetivo é fornecer uma interface gráfica simples para a conversão de arquivos para formatos populares, juntamente com poderosas opções de linha de comando para codificação automática.