Está com dificuldade para comparar e sincronizar seus arquivos e pastas? Para resolver seu problema, experimente instalar o FreeFileSync.
Instale o FreeFileSync no Ubuntu e derivados
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Instale o SyncDrive 0.9 no Ubuntu e derivados
Saiu a versão 0.9 do SyncDrive com o suporte a duas contas. Se você quiser experimentar essa versão, veja aqui como instalar o programa;
BitTorrent Sync vira beta, recebe controle de versoes e um app para Android
Está precisando de uma ferramenta segura para sincronização de arquivos peer-to-peer que funciona no Linux, Windows, Mac OS X e dispositivos NAS. BitTorrent Sync pode ser o que você quer.