Se você mexeu demais nas configurações do Unity e do Compiz, veja aqui como fazer para resetar as configurações de ambos e deixá-los com as configurações originais.
Compiz
Compiz no MATE: veja como instalar e ativar
Se você quiser experimentar o Compiz no MATE, veja como instalar e ativar esse recurso usando a ferramenta MATE Tweak.
