Se você precisa de um editor gráfico para simulações atomísticas periódicas, veja como instalar o Vipster no Linux via Flatpak.
Vipster é uma ferramenta poderosa e versátil para pré e pós-processamento de estruturas químicas periódicas. Ela foi projetada do zero com simulações periódicas em mente.
O Vipster é um editor gráfico rápido e fácil de usar para simulações atomísticas periódicas, executado em Windows, Linux, macOS e *BSD.
Ele suporta pequenas moléculas isoladas para cálculos mecânicos quânticos, grandes trajetórias periódicas para dinâmica molecular e tudo o mais.
Os recursos do Vipster incluem:
- Suporte total à periodicidade:
defina qualquer formato de célula arbitrário, exiba e determine ligações sobre limites periódicos. - Suporte para trajetórias com etapas fracamente acopladas:
Varie o número de átomos, célula unitária compartilhada ou discreta - Tipos de átomos e ligações personalizados:
use isótopos, tipos de átomos de campos de força especiais ou partículas abstratas simplesmente fornecendo um nome. - Visualização flexível:
componha várias estruturas, isosuperfícies, etc. em uma janela ou visualize uma única estrutura em várias janelas com diferentes perspectivas. - Edição prática:
selecione e manipule átomos e ligações por meio de atalhos do mouse e do teclado. - Suporte a formato de arquivo:
O Vipster suporta formatos conceitualmente diferentes ao separar dados de estrutura atômica de outros dados com tratamento especial. Até duas predefinições separadas podem controlar recursos específicos do formato e gerar arquivos de entrada para cálculos de forma confiável. - Scriptable:
Pequena linguagem de script integrada com procedimentos abreviados para muitos procedimentos de modificação regulares. - Interface Python:
O backend da biblioteca é totalmente acessível via Python para necessidades avançadas de script, tanto na GUI quanto de forma independente. - Extensível:
adicione suporte para mais formatos de arquivo fornecendo plugins definidos pelo usuário por meio da API Python ou C++.
Como instalar o Vipster no Linux via Flatpak
Para instalar o Vipster no Linux via Flatpak você precisa ter o suporte a essa tecnologia instalado em seu sistema. Se não tiver, use o tutorial abaixo para instalar:
Como instalar o suporte a Flatpak no Linux
Por usar a tecnologia Flatpak, é possível instalar o aplicativo no Ubuntu, Fedora, Debian, openSUSE, e todas as distribuições que suportam esse formato, usando esse tutorial.
Depois, você pode instalar o Vipster no Linux via Flatpak, fazendo o seguinte:
Passo 1. Abra um terminal;
Passo 2. Use o comando abaixo para instalar o programa via Flatpak. Tenha paciência, pois muitas vezes pode demorar vários minutos para que o Flatpak faça o download de tudo o que precisa;
flatpak install --user https://flathub.org/repo/appstream/io.github.sgsaenger.vipster.flatpakref
Passo 3. Para atualizar o programa, quando uma nova versão estiver disponível, execute o comando:
flatpak --user update io.github.sgsaenger.vipster
Pronto! Agora, quando quiser iniciar o programa, digite flatpak run io.github.sgsaenger.vipster
em um terminal.
Você também pode tentar iniciar o programa no menu Aplicativos/Dash/Atividades ou qualquer outro lançador de aplicativos da sua distro, ou digite vipster
ou em um terminal, seguido da tecla TAB.
Como desinstalar
Depois, se for necessário, para desinstalar o Vipster no Linux via Flatpak, faça o seguinte:
Passo 1. Abra um terminal;
Passo 2. Desinstale o programa, usando o seguinte comando no terminal:
flatpak --user uninstall io.github.sgsaenger.vipster
Ou
flatpak uninstall io.github.sgsaenger.vipster