Se você precisa ver ou construir modelos macromoleculares, conheça e veja como instalar o modelador Coot no Linux via Flatpak.
Coot é uma poderosa ferramenta de construção de modelos macromoleculares para analisar dados e modelos de raios X (por exemplo, proteínas, ligantes, RNA e DNA).
Um construtor de modelos macromoleculares é uma ferramenta ou software usado para construir e visualizar modelos tridimensionais de macromoléculas, como proteínas, ácidos nucleicos (DNA e RNA) e complexos moleculares.
Essas ferramentas permitem que cientistas e pesquisadores representem a estrutura e a organização atômica dessas moléculas, ajudando a entender sua função biológica e comportamento.
Eles são fundamentais na biologia estrutural, bioquímica e em campos como o design de medicamentos, onde esses modelos ajudam a prever como uma molécula pode se ligar a uma proteína alvo ou como reagirá em um ambiente biológico.
Existem muitas ferramentas para manipulação e construção de modelos, como minimização, superposição molecular, rotação/translações de fragmentos, ajuste de rotamer, construção de novo e refinamento.
Coot é usado por cientistas que usam cristalografia de raios X ou crio-EM para análise de proteínas, mapas de densidade eletrônica, interações de proteínas e design de medicamentos.
Como instalar o modelador Coot no Linux via Flatpak
Para instalar o modelador Coot no Linux via Flatpak você precisa ter o suporte a essa tecnologia instalado em seu sistema. Se não tiver, use o tutorial abaixo para instalar:
Como instalar o suporte a Flatpak no Linux
Por usar a tecnologia Flatpak, é possível instalar o aplicativo no Ubuntu, Fedora, Debian, openSUSE, e todas as distribuições que suportam esse formato, usando esse tutorial.
Depois, você pode instalar o modelador Coot no Linux via Flatpak, fazendo o seguinte:
Passo 1. Abra um terminal;
Passo 2. Use o comando abaixo para instalar o programa via Flatpak. Tenha paciência, pois muitas vezes pode demorar vários minutos para que o Flatpak faça o download de tudo o que precisa;
flatpak install --user https://flathub.org/repo/appstream/io.github.pemsley.coot.flatpakrefPasso 3. Para atualizar o programa, quando uma nova versão estiver disponível, execute o comando:
flatpak --user update io.github.pemsley.cootPronto! Agora, quando quiser iniciar o programa, digite flatpak run io.github.pemsley.coot em um terminal.
Você também pode tentar iniciar o programa no menu Aplicativos/Dash/Atividades ou qualquer outro lançador de aplicativos da sua distro, ou digite coot ou em um terminal, seguido da tecla TAB.
Como desinstalar
Depois, se for necessário, para desinstalar o modelador Coot no Linux via Flatpak, faça o seguinte:
Passo 1. Abra um terminal;
Passo 2. Desinstale o programa, usando o seguinte comando no terminal:
flatpak --user uninstall io.github.pemsley.cootOu
flatpak uninstall io.github.pemsley.coot